El papel estratégico de la Sede Santo Domingo se hizo evidente con el correr de los años, para 1980 fue la primera institución educativa superior en llegar a la ciudad. Está ubicada en el Km 4 ½ de la Vía a Chone, con una extensión de algo más de 29 hectáreas. Actualmente tiene una oferta académica de grado y posgrado:

Facultad Ciencias Administrativas

• Administración de Empresa
• Negocios Internacionales

Facultad Ciencias de la Ingeniería e Industria

• Electromecánica
• Ingeniería Industrial

Facultad Ciencias, Ingeniería y Construcción 

• Ingeniería Civil

Facultad Arquitectura y Urbanismo

• Arquitectura

Facultad Ciencias de la Salud

• Medicina Veterinaria
• Odontología

Facultad de Derecho y Ciencias Sociales

• Derecho en línea

Para el fortalecimiento académico, la Sede Santo Domingo cuenta con una amplia infraestructura:

Granja experimental   
La granja experimental ‘El Oasis’ tiene una extensión de 34 hectáreas, es utilizada por estudiante y docentes para el desarrollo de investigación y prácticas académicas de las carreras de agropecuaria y medicina veterinaria.

Clínica veterinaria
Está ubicada en el bloque C, es para las prácticas de los estudiantes de Medicina Veterinaria. Está dividida en cuatro áreas, en dos de ellas se trabaja desde el punto de vista clínico, en la tercera hay mesas y jaulas para las mascotas mientras se las evalúa. Y en la cuarta se trabaja en operaciones de los animales; se cuenta con dos quirófanos y anestesia inhalatoria.

Laboratorios y talleres
Hay 20 laboratorios, desde los polifuncionales hasta los de microbiología, morfofunción, máquinas eléctricas, control e instalaciones eléctricas, electrónica, automatización. Se suman los talleres de soldadura, máquinas y herramientas; una planta agroindustrial y una sala de simulación de audiencias.

También contamos con cuatro laboratorios de computación, dos aulas virtuales y el 100% de las aulas cuenta con tecnología multimedia.

Biblioteca

La biblioteca de la Sede Santo Domingo es una de las mejores equipadas de la zona, presta sus servicios a través de catálogos automatizados para un servicio más rápido y eficaz.

Auditorios
Para la realización de seminarios, talleres y otras actividades académicas funcionan  dos salones con capacidad para 200 personas cada uno; y un aula magna con capacidad para 80.

Centro médico
Este centro médico está al servicio de la Comunidad Universitaria, se ubica junto a la capilla. Y la especialista en medicina general atiende toda la jornada aboral.

Capilla
Usualmente se la usa en época navideña, donde se realizan eventos por esa fecha. Está abierta entre semana; posee a Cristo de hierro y el Sagrario.

Deportes
Para actividades de entretenimiento y distracción se encuentran cuatro canchas: la de fútbol y la de futbito son al aire libre y con césped natural; en cambio, la de baloncesto y vóley son de cemento. En esos espacios se realizan actividades de los clubes de deporte, teatro, danza y música.

Residencia   
La residencia universitaria Sede Santo Domingo es un espacio que brinda alojamiento a empleados, docentes e investigadores que son invitados a la UTE para cumplir actividades académicas, culturales y deportivas. Se cuenta con 5 cabañas, en las cuales hay 13 habitaciones individuales, dobles y triples. Para la comodidad de nuestros visitantes, cada cabaña cuenta con sala, comedor, cocina, recepción y WIFI.

Arqueología   
En función del compromiso con el resguardo y la difusión del patrimonio nacional, la UTE en Santo Domingo posee un rincón histórico arqueológico donde se exponen alrededor de 400 objetos de diferentes culturas del país: Tolita, Jama-Coaque, Bahía, Atacames, Milagro Manteña y Negativo del Carchi.